鎳柱
親和層析技術(shù)的基本原理在于,它依賴于分子間獨(dú)特的、高度特異性的相互作用,這些相互作用使得分子間能夠形成既專一又可逆的結(jié)合,這種力量我們稱之為親和力。
在生物科學(xué)中,存在多種具有專一性親和力的生物分子對(duì),例如:
酶與基質(zhì)類似物、抑制劑或輔酶之間;
抗體與抗原、病毒或細(xì)胞之間;
細(xì)胞與其表面的特異蛋白、外源凝集素之間;
核酸與互補(bǔ)堿基序列、組蛋白或核酸聚合酶之間;
激素或藥物與受體、載體蛋白之間;
外源凝集素與多糖、糖蛋白、細(xì)胞表面受體或細(xì)胞之間。
在親和層析過程中,那些能夠與待分離物質(zhì)特異性結(jié)合的分子被固定在色譜基質(zhì)上,這些被固定的分子被稱為配體。配體與基質(zhì)之間通過共價(jià)鍵緊密相連,共同構(gòu)成了親和層析的固定相,也被稱為親和吸附劑。為了構(gòu)建這種親和吸附劑,配體首先需要通過共價(jià)鍵與經(jīng)過活化的基質(zhì)相結(jié)合,從而形成固相載體。常用的載體材料包括瓊脂糖凝膠、葡聚糖凝膠、聚丙烯酰胺凝膠以及纖維素等,它們?yōu)橛H和層析提供了穩(wěn)定且高效的分離平臺(tái)。
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咪唑環(huán),作為一種五元雜環(huán)化合物,其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)是含有一個(gè)1,3-二氮雜環(huán),英文表述為Imidazole。若從咪唑環(huán)上位于第一位或第三位的氮原子上移除與之直接相連的氫原子,所得的部分則被稱作咪唑基團(tuán)。簡而言之,咪唑基團(tuán)是咪唑分子中去除一個(gè)與氮原子直接相連的氫原子后剩余的結(jié)構(gòu)片段。
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組氨酸的特性在于其輕微的疏水性以及咪唑環(huán)所賦予的微弱電性。
多種過渡金屬離子,如Cu²?、Ni²?、Zn²?、Co²?等,能與N、S、O等供電子原子形成配位鍵,進(jìn)而與蛋白質(zhì)表面的特定基團(tuán)如組氨酸(His)的咪唑基、半胱氨酸(Cys)的巰基以及色氨酸(Trp)的吲哚基發(fā)生強(qiáng)烈的親和性結(jié)合,其中咪唑基與金屬離子的結(jié)合尤為牢固。這些金屬離子與咪唑基的結(jié)合力按照Cu²?、Ni²?、Zn²?、Co²?的順序遞減。
鎳離子具有六個(gè)潛在的螯合位點(diǎn)。在鎳柱的應(yīng)用中,根據(jù)螯合位點(diǎn)的不同,鎳柱被分為Ni-NTA和Ni-IDA兩種類型。Ni-NTA螯合了四個(gè)位點(diǎn),留下兩個(gè)空位;而Ni-IDA則螯合了三個(gè)位點(diǎn),剩余三個(gè)空位。因此,Ni-IDA Agarose的結(jié)合能力相對(duì)更強(qiáng),能夠在相同條件下承載更多的蛋白質(zhì),但需要使用更高濃度的咪唑來洗脫雜質(zhì)和目標(biāo)蛋白。然而,Ni-NTA在穩(wěn)定性方面表現(xiàn)出優(yōu)勢,更能耐受強(qiáng)還原劑的作用,鎳離子不易脫落。因此,在選擇鎳柱時(shí),需要根據(jù)具體的純化條件進(jìn)行權(quán)衡,以達(dá)到最佳的純化效果。
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基質(zhì)特性概述:
基質(zhì)是一種具有多孔網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)的不溶性材料,其滲透性能優(yōu)異。它具備高度的物理和化學(xué)穩(wěn)定性,能夠承受較大的機(jī)械應(yīng)力,從而確保較長的使用壽命。此外,基質(zhì)還能有效抵抗微生物和酶的侵蝕,保持其結(jié)構(gòu)的完整性。理想的基質(zhì)應(yīng)具有均勻的球形粒子,以提高分離效率。同時(shí),基質(zhì)應(yīng)具有親水性,避免非特異性吸附,且含有可活化的反應(yīng)基團(tuán),便于親和配體的固定。
瓊脂糖凝膠微球?qū)嵗?/strong>:
瓊脂糖凝膠微球,商品名為Sepharose,根據(jù)其含糖濃度的不同,分為2B、4B和6B三種類型。其中,Sepharose 4B的結(jié)構(gòu)相對(duì)疏松,吸附容量適中,因此在實(shí)際應(yīng)用中最為廣泛。
配基的選擇原則:
配基是一種能夠可逆結(jié)合特定分子或基團(tuán)的分子,是親和色譜純化的關(guān)鍵。選擇配基時(shí),需考慮其特異性和可逆性,確保與目標(biāo)物能夠穩(wěn)定結(jié)合并易于分離。同時(shí),配基應(yīng)具有化學(xué)修飾基團(tuán),便于吸附在基質(zhì)上,且不影響其活性。
間隔臂的作用與選擇:
當(dāng)目標(biāo)蛋白質(zhì)的結(jié)合位點(diǎn)位于分子內(nèi)部時(shí),直接偶聯(lián)配基可能受到空間位阻的影響,導(dǎo)致結(jié)合能力降低。此時(shí),可在配基與基質(zhì)之間插入一個(gè)間隔臂,以提高結(jié)合效率。間隔臂的長度需適中,過短可能無效,過長則可能導(dǎo)致非特異性結(jié)合。一般來說,當(dāng)偶聯(lián)的分子量較小時(shí),需要使用間隔臂;而當(dāng)分子量較大時(shí),則不一定需要。
二硫鍵在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中的作用:
二硫鍵是蛋白質(zhì)中半胱氨酸殘基之間形成的共價(jià)鍵,對(duì)蛋白質(zhì)的立體結(jié)構(gòu)起著重要作用。為了確定蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu),需要打開二硫鍵,使其變?yōu)榫€狀多肽鏈。
親和層析的上樣與洗脫方式:
上樣方式包括直接上樣和間接上樣兩種。洗脫方式則根據(jù)配基和目標(biāo)物的性質(zhì)而定,包括pH值洗脫、離子強(qiáng)度洗脫和競爭性洗脫(如使用咪唑)。
親和層析柱的再生步驟:
為了恢復(fù)親和層析柱的性能,需要進(jìn)行再生處理。具體步驟包括:首先用強(qiáng)變性劑(如6M鹽酸胍)沖洗柱子以去除殘留的蛋白質(zhì);然后用水沖洗干凈;接著用0.2%SDS沖洗柱子以去除殘留的變性劑;再次用水沖洗干凈;之后用50%乙醇沖洗柱子以去除SDS;再次用水沖洗干凈;然后用含有Tris和EDTA的緩沖液(如100mM EDTA, 50mM Tris, pH 8.0)沖洗柱子以去除金屬離子;再次用水沖洗干凈;最后用100mM硫酸鎳孵育柱子以重新固定鎳離子;最后以20%乙醇保存柱子于4℃環(huán)境中備用。
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