GraphPad Prism使用指南

本文將為大家介紹一款功能強(qiáng)大的科學(xué)繪圖和數(shù)據(jù)分析軟件——GraphPad Prism。

如果你是初次接觸這款軟件，可能有些迷茫，不要擔(dān)心，本文將為你提供幫助。GraphPad Prism主要是面對醫(yī)學(xué)、生物科學(xué)等領(lǐng)域的數(shù)據(jù)處理，它包含了許多基本的面板特性和概念。如，你可以在GraphPad Prism中輸入或?qū)肽愕臄?shù)據(jù)，然后使用它的基本統(tǒng)計(jì)分析功能，如t檢驗(yàn)、ANOVA、方差分析、線性回歸等，對數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。在處理完數(shù)據(jù)后，你可以使用GraphPad Prism生成各種科學(xué)美觀的圖表，此外，GraphPad Prism還提供了一些實(shí)用的小技巧，如即時(shí)修改圖像、繪圖樣式標(biāo)準(zhǔn)化和期刊排版等。總的來說，GraphPad Prism是一款功能強(qiáng)大的科學(xué)繪圖和數(shù)據(jù)分析軟件，它可以幫助你使用自己的數(shù)據(jù)，執(zhí)行基本的統(tǒng)計(jì)分析操作，最后生成科學(xué)美觀的圖表。

歡迎面板

圖一

您可以根據(jù)自己的需求，選擇創(chuàng)建一個(gè)新的數(shù)據(jù)圖表，也可以選擇打開并編輯一個(gè)已有的文件。在創(chuàng)建新數(shù)據(jù)時(shí)，圖1左上角的"NEW TABLE & GRAPH"提供了8種不同類型的數(shù)據(jù)表供您選擇。此外，GraphPad Prism提供了兩種方式供使用者學(xué)習(xí)了解不同類型數(shù)據(jù)表的結(jié)構(gòu)和可執(zhí)行的統(tǒng)計(jì)分析：你可以參考GraphPad Prism官網(wǎng)的教學(xué)講解視頻，或者選擇軟件自帶的示例數(shù)據(jù)集學(xué)習(xí)教程 (Start with sample data to follow a tutorial)。以使用教程數(shù)據(jù)集為例，我們可以選擇新建Column數(shù)據(jù)集，創(chuàng)建常規(guī)的T test-Unpaired進(jìn)行實(shí)際操作（圖2）。

圖二

自由面板

圖三

圖四

在點(diǎn)擊創(chuàng)建后，教程數(shù)據(jù)集將出現(xiàn)在新打開的Prism項(xiàng)目文件中。在頁面上方工具欄中，我們可以看到多個(gè)實(shí)用的功能選項(xiàng)。以下是各個(gè)功能的詳細(xì)描述：

File：此按鈕用于選擇“創(chuàng)建新項(xiàng)目”或“保存現(xiàn)在的項(xiàng)目”。

Sheet：利用此功能，我們可以高亮工作表，添加筆記，添加或刪除工作表等。當(dāng)在圖表瀏覽器中懸停在圖表上時(shí)，此功能將顯示圖表的詳細(xì)信息，包括圖表類型，數(shù)據(jù)集，圖表大小，顏色等。

Undo：此功能用于撤銷上一步操作。

Clipboard：此功能用于復(fù)制粘貼數(shù)據(jù)。

Analysis：此功能用于進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析。

Change：此功能用于更改圖表類型、數(shù)據(jù)集順序，添加或刪除數(shù)據(jù)集，更換圖表顏色和大小等。

Arrange：此功能用于對齊或居中圖表中的對象。

Draw：此功能用于添加圖形形狀或添加成對比較的結(jié)果。

Write：此功能用于寫入文字。

Text：此功能用于對圖表中的文字進(jìn)行編輯，例如字體類型，字體大小、顏色和格式等。

Export：此功能用于導(dǎo)出項(xiàng)目，項(xiàng)目圖表可以另存為多種格式，如PDF，TIF，JPG，PNG和BMP等。

Print：此功能用于打印工作項(xiàng)目。

Send：此功能用于分享工作項(xiàng)目。

在左側(cè)導(dǎo)航面板中，我們可以看到所有工作表被按照五個(gè)模塊進(jìn)行分類排布：

Data Tables：此模塊用于存放原始數(shù)據(jù)集。

Info：此模塊用于存放項(xiàng)目信息表。

Results：此模塊用于存放結(jié)果分析表。

Graphs：此模塊用于存放圖表。

Layouts：此模塊用于存放布局排版。

在左側(cè)導(dǎo)航面板中，任何與當(dāng)前操作中的工作表相關(guān)的分析結(jié)果及圖表都會(huì)以粗體顯示。此外，左側(cè)導(dǎo)航面板下方是Family面板。在這部分面板中，僅有與當(dāng)前導(dǎo)航欄選中的工作表相關(guān)的內(nèi)容才會(huì)在此處出現(xiàn)顯示。

圖五

面板分析

在熟悉了基礎(chǔ)面板之后，下面我們就來學(xué)習(xí)怎樣對數(shù)據(jù)集展開統(tǒng)計(jì)分析。

當(dāng)完成數(shù)據(jù)導(dǎo)入后，在上方工具欄的【Analysis】里找到【Analyze】并點(diǎn)擊，接著選擇期望執(zhí)行的分析類型，例如【t test】，隨后點(diǎn)擊【OK】。這時(shí)會(huì)彈出一個(gè)新頁面，在【Experimental design】選項(xiàng)卡中，我們能夠依據(jù)實(shí)際需求對分析進(jìn)行相應(yīng)的選擇和修飾。比如，可以確定數(shù)據(jù)是否為配對形式，以及是否符合高斯分布等情況（如圖 6 所示）。并且，在此頁面的【options】選項(xiàng)卡內(nèi)，我們還可以選擇 P value 的計(jì)算方式以及其輸出格式等內(nèi)容。

在這個(gè)界面點(diǎn)擊【OK】之后，我們就會(huì)進(jìn)入結(jié)果分析表界面。在這個(gè)界面中，我們可以獲取一些關(guān)鍵信息，包括 P value、顯著性分析結(jié)果、均值差異以及 95% 置信區(qū)間差異等內(nèi)容。

圖六

圖表制作

在完成對數(shù)據(jù)集的分析處理工作后，接下來就要進(jìn)行圖表制作了。我們只需在左側(cè)導(dǎo)航欄點(diǎn)擊【Graphs】，就能查看圖表相關(guān)內(nèi)容。當(dāng)首次點(diǎn)擊時(shí)，新跳出的界面可供我們選擇喜愛的圖表類型與樣式，像箱型圖、小提琴圖、條形圖、散點(diǎn)圖之類的都可以選擇。而且，我們還能決定是否顯示均值、誤差、中位數(shù)以及誤差等信息（見圖7）。在選好圖表樣式后，點(diǎn)擊【OK】，相應(yīng)的圖表就會(huì)生成并呈現(xiàn)出來。

圖七

隨后，我們能夠借助上方工具欄里的工具，或者直接點(diǎn)擊圖表中的相應(yīng)部分，來對圖表進(jìn)行美化和修飾。比如，我們可以對 XY 軸坐標(biāo)進(jìn)行修改，也可以改變字體的類型、大小和顏色，還能對圖表框和原點(diǎn)等進(jìn)行自定義設(shè)置（圖 8）。

圖八

除此之外，點(diǎn)擊上方工具欄【Change】選項(xiàng)卡中的【Format Graph】，我們就能夠?qū)?shù)據(jù)集進(jìn)行自定義操作，像符號的外觀形狀、顏色以及大小等都可以自行設(shè)置（圖9）。

圖九

以上就是GraphPad Prism基本內(nèi)容和介紹，GraphPad Prism還有更多強(qiáng)大的內(nèi)容等待發(fā)現(xiàn)。

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