背景及概述[1]
連接酶是一種能催化兩個(gè)不同或相同分子的兩端相連接的酶,此反應(yīng)與ATP分解反應(yīng)相偶聯(lián)。T4RNALigase(T4RNA連接酶)是以不依賴于模板的形式催化供體核酸的5'-磷?;┒撕褪荏w核酸的3'-羥基末端形成磷酸二酯鍵。該酶活性依賴ATP,可作用于廣泛的底物,包括RNA,DNA,寡核糖核酸、寡脫氧核糖核酸和很多其它核酸衍生物。T4RNALigase主要用于RNA5´末端加寡聚核酸用于映射和測(cè)序5´端,或用于cDNA合成(RACE);用于3'-末端RNA標(biāo)記;用于連接RNA和DNA;用于修飾突變RNA。
制備方法[1]
T4RNALigase1可用于制備腺苷?;宇^,腺苷?;宇^能夠被截短型的T4RNA連接酶2特異性識(shí)別,在沒(méi)有ATP存在的條件下將腺苷?;宇^5’端有腺苷?;揎椀牧姿崤cRNA的3’端的羥基連接,形成3,5-磷酸二酯鍵。
其制備方法包括:
(1)先合成一段寡核苷酸,寡核苷酸5’端磷酸化修飾,3’端進(jìn)行氨基修飾、雙脫氧胞嘧啶、磷酸修飾、熒光標(biāo)記修飾、倒轉(zhuǎn)堿基修飾或生物素標(biāo)記修飾中的一種;
(2)將步驟(1)的寡核苷酸在非截短型的T4RNALigase1催化下與ATP反應(yīng),獲得腺苷?;宇^。
本申請(qǐng)的制備方法,打破傳統(tǒng)化學(xué)合成腺苷?;宇^的思維限制,先合成寡核苷酸,T4RNALigase1將ATP分解成AMP,AMP轉(zhuǎn)移到磷酸上,形成腺苷?;捎?’端修飾,寡核苷酸保持在腺苷?;虚g態(tài),從而制備出腺苷酰化接頭。本申請(qǐng)的制備方法成本低、效率高,能滿足使用需求,有效的降低了RNA高通量測(cè)序的成本。
參考資料
[1] CN201410391721.X一種制備腺苷?;宇^的方法及腺苷酰化接頭