近年來，新一代高通量測序技術得到了突飛猛進的發(fā)展，在此基礎上，高通量RNA測序即RNA-seq也迅速發(fā)展．與基因芯片技術相比，RNA-seq無需設計探針，能在全基因組范圍內(nèi)以單堿基分辨率檢測和量化轉錄片段，并能應用于基因組圖譜尚未完成的物種，具有信噪比高、分辨率高、應用范圍廣等優(yōu)勢，正成為研究基因表達和轉錄組的重要實驗手段．RNA-seq為基因組學的研究帶來了高分辨率的海量數(shù)據(jù)，如何有效處理和分析這些海量數(shù)據(jù)成為這一新技術能否帶來新的科學發(fā)現(xiàn)的關鍵，一些生物信息學方法與軟件也應運而生。小RNA測序（smallRNA測序）是RNA-seq的一種。